哈萨克斯坦分中心成立于2018年5月，随着哈萨克斯坦国家技术发展机构JSC（NATD JSC）技术转移中心主任DyussembayevMedet与时任东部中心执行副总裁邹叔君为双方代表，正式签署双方合作备忘录，东部中心正式启动中哈间科技创新合作。目前，东部中心哈萨克斯坦分中心业务推进的合作伙伴为QazTech Ventures JSC，位于哈萨克斯坦共和国的首都阿斯塔纳市。该控股公司的唯一股东是哈萨克斯坦政府，旨在通过风险融资、商业孵化、技术咨询等工具，促进创业公司技术发展，通过促进经济发展和多元化、吸引投资（含国家投资）、发展集群、提升其分公司及附属公司合作管理体系（转为信托组织），提升其工作透明度及效率。

目前，哈萨克斯坦分中心在当地的合作伙伴包括12家政府及企业、21家孵化器及加速器、3个园区和7家高校及科研机构，主要通过挖掘当地技术需求，匹配对接国内有效解决方案，推进哈萨克斯坦信息网络、农业及食品安全等领域的发展。